国家基因组科学数据中心发布2019新型冠状病毒资源库 2020-01-22 16:06:06 来源:中国新闻网 作者:刘欢 责任编辑:刘欢 2020年01月22日 16:06 来源:中国新闻网参与互动   中新社北京1月22日电 据中国科学院公众号22日消息,当日,国家基因组科学数据中心正式发布2019新型冠状病毒资源库。经数据分析,2019新型冠状病毒(2019-nCoV)与2003年爆发的SARS病毒基因组序列相似度为80%,与2017年2月从国内的蝙蝠中采集到的Bat SARS-like coronavirus isolate bat-SL-CoVZC45基因组序列相似性最高,相似度为88%。   该库整合了世界卫生组织(WHO)、中国疾病预防控制中心(CDC)、美国国家生物技术信息中心(NCBI)、全球流感序列数据库(GISAID)等机构公开发布的冠状病毒基因组序列数据、元信息、学术文献、新闻动态、科普文章。同时,对不同冠状病毒株的基因组序列做了变异分析与展示。   2019新型冠状病毒资源库收录了来源于NCBI的GenBank数据库和GISAID数据库发布的2019新型冠状病毒(2019-nCoV)病毒株的株名、采样日期、采样地点、样本提供单位、数据递交单位等元信息。通过该资源库还可访问到国家基因组科学数据中心基因组数据库GWH从公共数据库收录的冠状病毒科基因组和蛋白序列,用户可基于Accession号、种名、属名、采样日期、采样地点、宿主、分离源、发布日期等元信息筛选感兴趣的冠状病毒株,个性化选取序列进行下载以开展相关的科学研究。   2019新型冠状病毒资源库将持续更新元信息与基因组序列数据,实时监控NCBI的PubMed数据库中发表的2019新型冠状病毒和其他冠状病毒的学术文献、中新网与新华网发布的新闻,同步更新世界卫生组织与中国疾病预防控制中心发布的科普介绍,为用户开展学术研究、掌握科研进展、了解新闻动态与科学知识提供资源与窗口。   2019新型冠状病毒资源库基于不同参考基因组序列开展2019-nCoV病毒株基因组变异分析,并对结果进行了统计与可视化展示。通过对全基因组序列相似性比较和变异位点分析,获取2019-nCoV病毒株之间、2019-nCoV病毒株与SARS冠状病毒以及与类SARS冠状病毒蝙蝠株之间的变异程度、变异区域、变异碱基的详细信息。经数据分析,2019-nCoV与2003年爆发的SARS病毒基因组序列相似度为80%,与2017年2月从国内的蝙蝠中采集到的Bat SARS-like coronavirus isolate bat-SL-CoVZC45基因组序列相似性最高,基因组序列相似性最高,相似度为88%。   对2019-nCoV病毒株的基因组变异分析可为追溯病毒来源、追踪病毒株变异路径、防控新型冠状病毒引发的疫情、治疗病毒性肺炎提供重要的数据基础与决策支持。(完) 【编辑:刘欢】 更多精彩内容请进入国内新闻 国内新闻精选: 崔天凯:认真落实第一阶段经贸协议是当务之急 2020年01月23日 10:00:53 教育部:严查校外培训机构寒假期间超前超标培训等 2020年01月23日 09:12:38 深圳一国企年会喝掉16万茅台:董事长被开除党籍 2020年01月22日 16:44:35 中国积极推进加入工业品外观设计国际注册海牙协定工作 2020年01月22日 16:17:27 交通运输部:2020年春节假期小型客车免收通行费 2020年01月22日 15:12:28 河北省政府原党组成员、副省长李谦严重违纪违法被双开 2020年01月22日 11:51:57 宁吉喆:稳健前行,迎难而上,成绩来之不易 2020年01月22日 07:45:02 综合施策、标本兼治 新疆反恐去极端化的成功经验 2020年01月22日 07:30:23 “雪龙2”号完成多项任务后抵达开普敦港 2020年01月21日 14:32:33 官方:持出入境证件旅客可完成进出站电子客票检票 2020年01月21日 10:57:11

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